うまく表現できないのですが、
トップページのみ例外で、「http://www.exmample.com/」のような、
「index.html」がない表記が好まれると考えていたので、
トップページだけURLの正規化ができる方法をお尋ねしました。

トップページは「index.html」なし、サブディレクトリは「index.html」ありという、URLの正規化もありなのでしょうか。

*** Reply from Suzuki Kenichi ***

トップページは「index.html」なし、サブディレクトリは「index.html」ありという、URLの正規化もありなのでしょうか。

技術的には可能ですが、ありかなしかと聞かれれば、僕としては「なし」です。

トップページのみ例外で、

このように判断する根拠はなんですか？
データに基づく結論でしょうか？

サイト内で表記が違う方が、違和感があると「僕は」思います。

P.S.
index.htmlありとなしのどちらか片方だけしか、インデックスされていないし、今後も両方がインデックスされることがないうなら、無理に正規化する必要はありません。
トップページのリンクは常に「/」、サブページのリンクは常に「index.html」付にしておけば、済む問題です。
ただし、他のサイトからのリンクまではコントロールできないことをお忘れなく。

この記事を参考にURLの正規化を行ってみました。
すると、トップページはうまく「http://www.exmample.com/」で統一できました。

ですが、「http://www.exmample.com/link/index.html」など、
階層の低いフォルダ内の「index.html」も同様にURLの正規化が起きてしました。
（「http://www.exmample.com/link/」と表示される）

.htaccessファイルによる301リダイレクトの効力が
階層の低いフォルダにも働いていると考えられますが、
トップページのみ、URLの正規化することは可能なのでしょうか。

教えていただければ幸いです。よろしくお願いいたします。

*** Reply from Suzuki Kenichi ***
Options +FollowSymLinks
RewriteEngine on
RewriteRule ^index.html$ http://www.example.com/ [R=301,L]

SEO塾の石崎さんに教えてもらいました。（笑）

ただ、なぜトップページだけを正規化するのでしょうか？
サブディレクトリは、分散してもいいということですよね。
よければ、理由を聞かせてください。

*** Reply from Suzuki Kenichi ***
生まれて初めて作ったサイトは、indexあり・なしの両方でリンクを貼ってました。（笑）